Yo me la acabo de adquirir y estoy supercontento con ella. Así que mi opinión está limitada a 48 Hrs de uso.
La verdad que nunca tuve tu duda, porque también tengo pensado adquirir la 3DSXL más adelante si vuelven a lanzar DQ exclusivos para ella.
Si tienes una DS, o has jugado con ella, ya sabes lo que te puede dar la 3DS, aunque con el 3D y mayor potencia gráfica.
En cambio la Vita es, desde mi punto de vista, una consola más completa al tener otras funciones que ni la 3DS es capaz de soportar. Si ya tienes PS3 y/o PS4, sabes que se completan a la perfección con las funciones Cross Buy, Cross Play, Cross Save o Cross Goods.
En potencia y calidad la Vita gana por goleada a 3DS, aunque ésta última a día de hoy parece que tiene mejor catálogo de juegos en la Vita se espera muchos grandes lanzamientos para el próximo año. A día de hoy puedes jugar en ella al Uncharted, el Soul Sacrifice, Tearaway o el AC3L entre otros tantos juegos.
En definitiva, aunque una es más potente que la otra y tiene más posibilidades multimedia, siempre la decisión hay que basarla en el catálogo de juegos, el que más te atraiga esa es la consola que debes de comprar.
Saludos.